Теоретические основы физики функционирования белков

ЛекциЙ: 24 часа

Практических занятий: 10 часов

Самостоятельная работа: 34 часа

2 курс магистров (3 семестр)
2 курс магистров (4 семестр)
Программа курса: 

 

1. ОБРАЗОВАНИЕ, СОСТАВ И СТРУКТУРА БЕЛКОВ.
1.1. СОСТАВ БЕЛКОВ. АМИНОКИСЛОТЫ И ИМИНОКИСЛОТА ПРОЛИН.
1.2. ОБРАЗОВАНИЕ БЕЛКОВ. ПЕРВИЧНАЯ СТРУКТУРА.
1.3. ВТОРИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА.
1.4. ТРЕТИЧНАЯ И ЧЕТВЕРТИННАЯ СТРУКТУРЫ.
1.4.1. Связь третичной и четвертинной структур с первичной.
1.4.2. Проблемы, связанные со степенью отображения значимости и физических свойств аминокислот и пролина в генетическом коде.
1.4.3. Миоглобин, гемоглобин и принцип функционирования ферментов.
1.4.4. Мембранные и мышечные белки.
1.5. ОБ ЭНЕРГЕТИКЕ И ПРИНЦИПАХ ФУНКЦИОНИРОВАНИЯ БЕЛКОВ.

2. КОНФОРМАЦИОННЫЕ ВОЗБУЖДЕНИЯ БЕЛКОВЫХ МОЛЕКУЛ.
2.1. ГИДРОЛИЗ АТФ И ВОЗБУЖДЕНИЕ АМИД-1.
2.2. ОПЕРАТОР ЭНЕРГИИ ВНУТРИ-МОЛЕКУЛЯРНЫХ ВОЗБУЖДЕНИЙ БЕЛКОВ.
2.3. ВОЗБУЖДЕНИЕ АМИД-1 В КЛАССИЧЕСКОЙ МОДЕЛИ АЛЬФА-СПИРАЛЬНОГО УЧАСТКА БЕЛКА.
2.4. КОНФОРМАЦИОННЫЙ ОТЗЫВ АЛЬФА-СПИРАЛЬНОГО УЧАСТКА МОЛЕКУЛЫ БЕЛКА НА ВОЗБУЖДЕНИЕ.
2.5. БАЗОВЫЕ СООТНОШЕНИЯ ДЛЯ ТОЧНОГО ОПИСАНИЯ ГЕОМЕТРИИ АЛЬФА-СПИРАЛИ.

3. ЭНЕРГЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ЭЛЕКТРОННОЙ ПОДСИСТЕМЫ БЕЛКОВ
3.1. АЗОТНО-КИСЛОРОДНАЯ МОДЕЛЬ
3.2. ВЗГЛЯД НА ПРОБЛЕМУ НУКЛЕОТИДНОГО КОДИРОВКИ АМИНОКИСЛОТ С ТОЧКИ ЗРЕНИЯ ФИЗИЧЕСКИХ СВОЙСТВ БЕЛКОВ.
3.3. ОПЕРАТОР ЭНЕРГИИ ЭЛЕКТРОННОЙ ПОДСИСТЕМЫ БЕЛКОВ В АЗОТНО-КИСЛОРОДНОЙ МОДЕЛИ: КООРДИНАТНОЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЕ.
3.4. ОПЕРАТОР ЭНЕРГИИ ЭЛЕКТРОННОЙ ПОДСИСТЕМЫ БЕЛКОВ В АЗОТНО-КИСЛОРОДНОЙ МОДЕЛИ: ПРЕДСТАВЛЕНИЕ ЧИСЕЛ ЗАПОЛНЕНИЯ. ИНЖЕКЦИЯ ЭЛЕКТРОНА.
3.5. ВЛИЯНИЕ ВНЕШНИХ ПОЛЕЙ.
3.6. НЕКОТОРЫЕ ЭКСПРЕСС-ОЦЕНКИ ДЛЯ МАТРИЧНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ .
3.7. СОСТОЯНИЯ ПРОВОДИМОСТИ БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЫ.
3.8. СПОСОБЫ РАСЧЕТА ТОКА.
3.8.1. Дисперсионный способ определения плотности тока.
3.8.2. “Прямой” способ определения плотности тока.

Контроль знаний: 

Зачет

Литература: 

Основная

1. А. Д. Супрун. Квантовая теория конформационных возбуждений белковых молекул. К.: ИВЦ “Киевский университет”. 2005 (на украинском языке).
2. А. С. Давыдов. Теория молекулярных экситонов. М.: Наука. 1968.
3. А. С. Давыдов. Биология и квантовая механика. К.: Наукова думка. 1979.
4. Э. Г. Петров. Физика переноса заряда в биосистемах. К.: Наукова думка. 1984.

Дополнительная

5. А. С. Давыдов. Солитоны в молекулярных системах. К.: Наукова думка. 1984, 1988.
6. М. В. Волькенштейн. Физика ферментов. М.: Наука. 1967.
7. Дж. Бендолл. Мышцы, молекулы и движение. М.: Мир. 1970.
8. В. М. Степанов. Молекулярная биология. Структуры и функции белков. М.: Высшая Школа. 1996.
9. Д. С. Чернавский, Н. М. Чернавская. Белок – машина. Биологические макромолекулярные конструкции. М.: Изд-во МГУ. 1999.
10. А. Б. Рубин. Биофизика. Т. 1. М.: Книжный дом "Университет". 1999.